MERRADI, Manel (2022) Pseudomonas aeruginosa au CHU de Batna : Epidémiologie, résistance et Options thérapeutiques. Doctoral thesis, Université de Batna 2.
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Abstract
Pseudomonas aeruginosa est un pathogène hospitalier majeur impliqué dans plusieurs infections sévères en plus de sa grande résistance aux antibiotiques. Ce problème récent est en croissance continue et menace de nombreux pays à travers le monde notamment l’Algérie. L’objectif de ce travail a été d’étudier la résistance aux antibiotiques et ses supports génétique sur un panel de 227 souches, collectées sur une période de 24 mois des services du CHU de Batna, Algérie. Ainsi qu’évaluer la formation de biofilm chez les souches isolées et étudier l’activité antibactérienne des huiles essentielles de huit plantes contre ces souches. Les souches ont été identifiées par deux techniques : Api20NE et MALDI-TOF MS. L'antibiogramme a été réalisé par méthode de diffusion sur gélose et des CMI en milieu liquide sur microplaque avec étude moléculaire des gènes de résistance (PCR, séquençage) et de typage moléculaire (MLST et de PFGE). La formation de biofilm a été réalisée selon trois techniques : CRA, TM et la TCP. L’évaluation de l’activité antibactérienne des huiles essentielle a été faite par la méthode de diffusion sur gélose. Nos résultats rapportaient une prévalence variable de résistance des isolats à la plupart des antibiotiques testés principalement aux β-lactamines et aux aminoglycosides. Nos souches ont été isolées principalement chez des brûlés du sexe masculin. 19,38% des isolats ont été résistantes aux carbapénèmes, parmi lesquels 32 souches hébergeaient des gènes de carbapénèmaseblaVIM-4, 10 souches avaient comme autre mécanisme de résistance aux carbapénèmes la surexpression des systèmes d’efflux. Un total de 5 souches résistantes aux fluoroquinolones par mutations dans les gènes gyrA, gyrB, parC et parE de même les résistants à la colistine étaient 4 souches présentant des mutations dans les systèmes PhoPQ et PmrAB. Le génotypage a révélé une diversité des séquences types avec une épidémie engendrée par le ST244 et une relation clonale démontrée dans le typage par PFGE. Les isolats capables de former un biofilm étaient de: 24%, 19% et 27% selon la technique CRA, TM et TCP respectivement. Les HE ont montré une variabilité dans leur activité antibactérienne où les HE d’eucalyptus, de lavande et d’estragon ont montré l’effet le plus faible. Ces résultats soulignent la diffusion des souches multirésisantes et virulentes ce qui incite la mise en œuvre de politique de surveillance de la résistance aux antibiotiques et d’implanter des stratégies de lutte contre cette résistance.
| Item Type: | Thesis (Doctoral) |
|---|---|
| Uncontrolled Keywords: | Pseudomonas aeruginosa, résistances aux antibiotiques, biofilm, huiles essentielles, CHU de Batna. |
| Subjects: | Sciences de la nature et la vie > Microbiologie et de biochimie |
| Divisions: | Faculté des sciences de la nature et la vie > Département de microbiologie et de biochimie |
| Date Deposited: | 24 May 2022 11:42 |
| Last Modified: | 24 May 2022 11:42 |
| URI: | http://eprints.univ-batna2.dz/id/eprint/2025 |
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